本发明公开了一种高空气球电池标定用太阳跟踪控制方法。该方法采用四象限传感器和视日运动轨迹算法两种追踪模式;太阳跟踪控制系统除设有主程序外,还设有自动搜寻目标子程序、跟踪点附近防抖动子程序、高速返回三圈子程序,以保证高空太阳跟踪的精度及可靠性;通过无线电对太阳跟踪控制系统进行远程遥控和跟踪状态检测传感器信号下传,地面依据该信号进行控制模式选择和系统启停;跟踪状态传感器及多块被标定太阳能电池的输出电压信号、环境温度、湿度、气压、吊篮内温度等检测信号通过CR1000采集并存储在记录仪中。本发明旨在提供一种移动载体上使用的高精度、高可靠性太阳跟踪控制方法。