本发明涉及一种用于全脑网络连接的无创刺激和检测的系统与方法,属于生物医学技术领域,系统包括架体、控制模块、照明模块、图像采集模块、超声刺激模块和图像处理模块;方法包括:将小鼠固定在架体的组合位移平台内;照明模块向小鼠的脑体同时进行470nm和617nm的照射;图像采集模块采集小鼠脑体图像信息;超声刺激模块对小鼠全脑超声刺激;图像处理模块将图像信息输出为钙离子荧光信号和脱氧血红蛋白代谢信号以及脑功能连接信号,控制模块控制超声刺激模块对小鼠大脑进行调控治疗。本发明能够自动检测全脑脱氧血红蛋白和钙离子浓度的相对变化,观察超声刺激对神经活动与血氧代谢活动的影响,实现了检测和治疗的一体化。