本发明公开了一种基于多通道神经信号分析的信号间耦合强度的判断方法,其包括以下步骤:S1、在脑电数据库中选取多通道脑电信号;步骤S2:对选取的信号的两个时间序列进行预处理;S3、计算两个时间序列的的边缘概率分布函数,及两个时间序列的熵,并基于联合概率函数计算联合熵;S4、计算两个时间序列的原始排序交叉互信息;S5、计算替代的时间序列以及替代时间序列的PCMI;S6、计算纯正PCMI。本发明可以估计不同通道间信号的真实连接强度,能有效降低由于不同通道间信号相互干扰而产生信号伪迹对通道间信号强度评估结果的影响。