本发明公开了一种鲤鱼脑立体定位辅助装置及定位方法，属于脑立体定位领域。本发明解决了常规脑立体定位仪所使用的三维坐标系与鲤鱼颅骨表面有一定角度差异导致定位不准确的问题。本发明装置由固定台、鱼体固定块、鳃杆、滑杆、滑杆轨道、箱体、滑块轨道、滚轮等组成，在使用时将装置置于脑立体定位仪底座上，将麻醉的鲤鱼放在装置的固定台上，使固定台倾斜，令鲤鱼颅骨表面与脑立体定位仪底座平行进行操作。本发明有益效果是不必将鲤鱼脑组织磁共振扫描坐标转化为脑立体定位仪所在坐标，可直接根据鲤鱼脑组织磁共振坐标进行操作，定位准确、操作简捷。本发明主要适用于鲤鱼的脑立体定位，也可应用在与鲤鱼颅骨结构相似的其它种类鱼的脑立体定位。
