一种基于微流体驱动的斑马鱼卵旋转微操作系统及控制方法,该系统主体为一微流控芯片,所述微流控芯片内设有两条呈一定角度的液体流入微管道和液体流出微管道,一个细胞室;所述细胞室侧壁与液体流入微管道和液体流出微管道相通连;所述液体流入微管道的截面面积小于液体流出微管道的截面面积。当控制流体以一定速度从液体流入微管道经细胞室侧壁流入液体流出微管道时,流体驱动力带动细胞自动产生旋转运动,细胞旋转速率和角度可通过高精密注射泵控制流体流动的速度和时间,实现自动调节。本发明系统操作精度高、自动化程度高、重复性强、价格低廉、操作简单,采用本发明系统辅助确定注射位点,具有较高的定位精度,因此能够大大提高显微注射成功率。