本发明涉及一种脑电信号分类方法及系统。该分类方法包括:获取原始脑电信号数据;所述原始脑电信号数据为用户想象运动时采集的脑电信号数据;利用工空间模式算法对所述原始脑电信号数据进行特征提取,得到所述原始脑电信号数据对应的脑电特征;计算所述脑电特征中单次试验脑电信号对应的判别分数;获取分类器模型;所述分类器模型利用广义二次判别分析算法构建;判断所述判别分数是否大于或等于所述分类器模型中的分类标准;如果是,将所述判别分数对应的脑电信号数据确定为第一运动类别;如果否,将所述判别分数对应的脑电信号数据确定为第二运动类别。本发明可以提高脑电信号分类准确度。