本发明涉及一种不等厚拼焊板材的拼焊方法及系统。该发明包括：获取待拼焊且厚度差值大于等于3mm的不等厚拼焊板材中薄板板厚和厚板板厚；根据薄板板厚和厚板板厚确定薄板坡口面与厚板坡口面之间的坡口角度；根据所述坡口角度确定薄板的接头与厚板的接头；根据薄板板厚和厚板板厚确定厚板的过渡角度以及过渡角度的位置；根据过渡角度以及过渡角度的位置对厚板的接头进行二次优化；对经过一次优化后薄板的接头和二次优化后厚板的接头进行对接拼焊。本发明能够保证不等厚板材实现拼焊全熔透，提高拼焊板材综合力学性能和拼焊板的均匀塑性成形能力。
